Zakażenia

Jak odróżniać ekspozycję, kontaminację, kolonizację, zakażenie bezobjawowe, chorobę, latencję i nosicielstwo na podstawie niszy, czasu, szkody i transmisji.

Jak droga wejścia, dawka dostarczona i efektywna, tropizm, bariery, odporność oraz mikrobiota wspólnie kształtują prawdopodobieństwo zakażenia i choroby.

Od pierwszego wiązania z receptorem przez przejście trans- i parakomórkowe po rozsiew limfatyczny, krwiopochodny, wewnątrz leukocytów i wzdłuż nerwów.

Mechanizmy działania toksyn białkowych, porów, LPS/LOS i superantygenów oraz różnice między genem, aktywną cząsteczką, jednostką endotoksynową i skutkiem u gospodarza.

Jak odróżniać obecność drobnoustroju lub jego genomu we krwi od zakażenia krwi, sepsy i wstrząsu oraz prawidłowo interpretować posiew, DNAemię i dysfunkcję narządową.

Jak przełożyć decyzję kliniczną, lokalizację zakażenia i fazę choroby na wybór reprezentatywnego materiału, analitu oraz metody mikrobiologicznej.

Jak objętość, aseptyka, podłoże, atmosfera, temperatura, czas i opakowanie zachowują tożsamość, integralność oraz bezpieczeństwo próbki mikrobiologicznej.

Jak odróżniać zakażenie, kolonizację i kontaminację na podstawie miejsca pobrania, niezależnych próbek, ilości sygnału, gospodarza, kontroli oraz wzorca całego procesu.

Od rozdzielczości, kontrastu i preparatyki przez barwienia Grama, kwasooporne, grzybicze i Giemsy po czułość, artefakty, kontrolę jakości oraz bezpieczne raportowanie obrazu.

Jak podłoże, sposób posiewu, atmosfera i inkubacja selekcjonują wzrost oraz jak przejść od kolonii przez kulturę czystą do ostrożnej identyfikacji fenotypowej.

Od cyklicznej amplifikacji, starterów i sond przez Cq, ekstrakcję oraz kontrolę inhibicji po korzyści i pułapki wielocelowych paneli syndromowych.

Jak odróżniać LoD od czułości klinicznej, zbudować tabelę 2×2, obliczać PPV, NPV i ilorazy wiarygodności oraz oceniać próg, ROC, bias i użyteczność testu.

Mapa bakteryjnych celów leków: peptydoglikan, błony, rybosom, polimeraza RNA, topoizomerazy, foliany i energetyka — od dostępu do celu po skutek populacyjny.

Co mierzą MIC, MBC i średnica strefy, jak powstają w metodach rozcieńczeniowych i dyfuzyjnych oraz dlaczego wynik zależy od standaryzacji, kontroli jakości i właściwej interpretacji.

Jak bakterie hydrolizują lub modyfikują lek, przebudowują i chronią cel, wypompowują antybiotyk oraz ograniczają jego napływ przez osłony komórkowe.

Jak odróżnić oporność wrodzoną i nabytą od tolerancji, persystencji, heterooporności i przejściowej adaptacji oraz jak dobrać właściwy pomiar do każdego fenotypu.

Jak czynnik przechodzi z rezerwuaru przez wrota wyjścia i drogę transmisji do podatnego gospodarza oraz które warstwy skutecznie przerywają ten łańcuch.

Jak dobierać licznik, populację zagrożoną, osoboczas i okres dla zapadalności, chorobowości, umieralności oraz odsetka zgonów wśród przypadków.

Jak odróżniać oczekiwaną obecność od nadmiaru, lokalne ognisko od niepotwierdzonego klastru oraz globalny zasięg pandemii od formalnych alarmów IHR.